OVA版结局与TV不同，具体如下这部作品以其深刻的主题与创新的表现方式吸引着每个观众。3年前的那场事故，使得凉宫遥以及鸣海孝之的人生发生了巨大的变化。遥昏睡了整整三年，即便是苏醒后的短时间内，记忆也一直是处在混乱状态。孝之因为遥的事故而深受打击，过着茫然自失的生活。但是全靠了速濑水月献身性的努力，虽然几经周折但还是振作了起来。现在在Family‐restaurant——Skytemple打工中。遥也找回了记忆，病情也康复了，马上就能够出院了。随后在遥出院的当天，孝之和好朋友平慎二、遥的父亲宗一郎以及遥的妹妹茜一起，前往医院迎接出院了的遥。但是在那里，并没有出现一直支撑着孝之，甚至想到过了结婚的水月的身影……